Bij vliegtickets waar een trein of bussegment inbegrepen zitten, is online inchecken niet mogelijk. Hiervoor geldt een aparte procedure.
Voor vliegtickets waarbij er in het vluchtschema een of meerdere segmenten worden uitgevoerd door een andere luchtvaartmaatschappij is een online check-in meestal niet mogelijk.
Als je langer dan 24u voor vertrek probeert online in te checken.
Als je tracht in te checken met een verkeerd confirmation number en/of verkeerde naam. Of als je dit doet bij de verkeerde luchtvaartmaatschappij.
Op vluchten met Turkish Airlines naar Eskisehir, die gecharterd worden door flybru.be, is online inchecken ook niet mogelijk. Afhankelijk van de klasse waarvoor je hebt geboekt, krijg je op de luchthaven bij het inchecken je plaats toegewezen volgens het principe "first come, first served". Als je vroeg incheckt heb je meer keuze voor je zitplaats in de geboekte klasse.